公司员工的著作权申请流程：

1、办理著作权和办理其他的手续一样，都必须拿着相关材料到所在地省、自治区、直辖市版权局申请进行办理。

2、填写完整的著作权申请表，一定要注意，里面的内容必须都是真实可靠的，以防过不了审查。

3、还包括申请人的身份证明，例如身份证，护照等等，还有作品的说明书要详细介绍申请著作权的作品是什么样子的。

4、拿好了以上的手续之后，就可以到登记机构来进行提交材料以及缴费等一系列的步骤和手续。

5、这些手续办好之后会进行相应的审查，如果审查之后觉得这个著作权是可以被注册申请的，就可以发放登记证书，并向社会公告。

6、通常来讲，这一系列的办理手续会在30个工作日之内完成，在此期间如果有一些材料需要补充提交或者是修正的话，申请人会在两个月之内来进行补充和修正，在此之后的30个工作日之内就可以办理完成了。

此外还需要确认是职务作品还是个人作品，职务作品是指公民为完成法人或者其他组织工作任务所创作的作品。一般而言，职务作品的著作权由作者享有，但法人或其他组织有权在其业务范围内可优先使用。

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