软件著作权（软著）的申请数量在理论上是没有明确限制的，您可以同时申请多个软著。但在实际操作中，最好咨询相关版权局的官方指南或规定，以确保您的操作符合最新的政策和法律要求。

当软著由多个人共同申请时，确实可以要求申请多个证书，但通常只有一个正本证书，其余为副本证书。这些证书的法律效力是相同的，但正本证书通常被视为官方的主要证明文件。

值得注意的是，如果您希望高效地完成软著登记，委托给专业的代理机构是一个明智的选择。这些机构对软著登记的流程和要求非常熟悉，能够为您提供专业的指导和帮助，确保您的申请能够顺利、快速地完成。通过代理机构的协助，您不仅可以节省时间和精力，还能提高申请的成功率。

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